東南大學醫學院位于風景秀麗的玄武湖畔，高校群集的市中心。醫學院前身為創建于1935 年的中央大學醫學院，人文歷史底蘊深厚，人才培養有口皆碑。其后又歷經南京大學醫學院、中國人民解放軍第五軍醫大學、南京鐵道醫學院等重要時期。
一批聲名卓著的醫學名家和教育大家如戚壽南、潘銘紫、鄭集、蔡翹、康錫榮、郭紹周、姜泗長、陰毓璋、張致一、王世真、丁光生、王士雯、張滌生、牟善初、賀林、楊煥明等均在這片土地上工作或學習過，他們為祖國的醫藥衛生事業做出了巨大貢獻。經過八十年的歷程和幾代人的奮斗，醫學院現已發展成為東南大學培養醫學與生命科學精英人才的重要基地.
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學院擁有一支以學術造詣較深的專家教授為龍頭、中青年骨干教師為主體、結構優良的教學科研隊伍。有一大批從國外歸來或引進的年富力強的學科帶頭人和獲國內著名高校博士學位的中青年骨干教師。
現有“長江學者獎勵計劃”特聘教授1名;國家杰出青年基金獲得者4 名;國家自然科學基金優秀青年基金獲得者1名;國家“973”首席科學家2 名;教育部新世紀優秀人才8 名;江蘇省特聘教授2 名;江蘇省“333”工程和“青藍工程”學術帶頭人和優秀骨干教師30 多名;國家、省部級“有突出貢獻”的中青年專家多名。
