學院前身可追溯到1924年成立的潮州產科傳習所。歷經汕頭市產科學校、汕頭市立高級助產職業學校、汕頭市立高級助產技術學校、汕頭市衛生技術學校、廣東省第七衛生學校、汕頭衛生學校、汕頭醫學專科學校等數度更名、重組;1983年9月經國務院批準，并入汕頭大學，升格為汕頭大學醫學院;1990年8月開始招收碩士研究生;1998年6月獲博士學位授權點;2001年4月設立博士后科研流動站;2010年成為中國第一所招收歐美國家本科起點留學生的醫學院校;2014年，列入北京協和醫院選拔優秀臨床實習生重點高校。
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汕頭大學醫學院共承擔各類基金項目1269項，總經費1.66億(含廣東省高水平重點學科建設項目1項，3000萬元)，其中973項目課題2項，國家自然科學基金(廣東聯合基金)重點項目7項，廣東省自然科學基金研究團隊項目2項，廣東省自然科學基金杰出青年基金項目1項。有1101篇論文被SCI收錄，篇均影響因子3.2。
2013年，由汕頭大學醫學院國際感染與免疫研究所管軼教授率領的國際研究團隊相繼在國際頂級雜志《Nature》和《Science》發表相關論文，報導H7N9病毒的感染、傳播和致病性，2015年該團隊又以汕大醫學院為并列第一作者再次在《Nature》上發表相關論文，在流感病毒研究方面屢創佳績，至此該團隊已在這兩個雜志發表論文5篇。共有65項科技成果獲得教育部、省、市科學技術獎，包括獲得教育部高等學校科學研究優秀成果獎(科學技術)自然科學獎一、二等獎各1項。
